Quando si coltivano Actinomiceti filamentosi, la principale difficoltà legata alle operazioni unitarie consiste nel controllare un brodo viscoso e non newtoniano senza compromettere il trasferimento di ossigeno o danneggiare l’organismo. I sistemi pilota e produttivi richiedono pertanto agitazione ad alta coppia, giranti adatte ai fluidi viscosi, aerazione e sparging efficaci, un controllo affidabile di temperatura e pH e un monitoraggio che tenga conto dei cambiamenti nella morfologia miceliale. La configurazione ottimale varia a seconda che l’obiettivo sia un antibiotico oppure un enzima extracellulare per l’idrolisi dell’amido o della cellulosa.
I processi con Actinomiceti devono essere progettati considerando morfologia e reologia, non trattati come fermentazioni batteriche a bassa viscosità. La chiave consiste nel mantenere ossigenazione e miscelazione adeguate durante tutta la coltura, controllando al contempo il taglio, la schiuma, la gestione dei solidi e le separazioni a valle.
Perché le colture di Actinomiceti richiedono apparecchiature specializzate
La crescita filamentosa modifica il comportamento del brodo
Gli Actinomiceti formano ife lunghe e ramificate, che possono svilupparsi come filamenti dispersi, ammassi, pellet o aggregati densi. Queste strutture possono aumentare considerevolmente la viscosità apparente e produrre un flusso non newtoniano, il che significa che il brodo può diventare più facile da movimentare a velocità di taglio elevate, ma rimanere scarsamente miscelato nelle regioni a basso taglio.
Con l’aumento della concentrazione di biomassa e prodotto, nel brodo possono svilupparsi gradienti di ossigeno disciolto, nutrienti, pH, temperatura e concentrazione del substrato. Un recipiente che funziona bene con una coltura batterica liberamente sospesa può quindi diventare inadeguato nelle fasi avanzate di una fermentazione con Actinomiceti.
La richiesta di ossigeno aumenta le difficoltà ingegneristiche
La biomassa filamentosa può creare limitazioni interne alla diffusione nei pellet o nelle regioni ifali dense. Anche quando il liquido sfuso mostra una lettura accettabile dell’ossigeno disciolto, l’ossigeno può essere localmente esaurito all’interno degli aggregati o nelle zone scarsamente miscelate.
Il bioreattore deve fornire una capacità sufficiente di trasferimento dell’ossigeno, comunemente espressa attraverso il coefficiente volumetrico di trasferimento di massa e la richiesta di ossigeno per la respirazione. Agitazione, dispersione del gas, geometria del recipiente, pressione, flusso d’aria e strategia antischiuma influenzano tutti questo equilibrio.
La morfologia è una variabile di processo
La morfologia influenza viscosità, trasferimento di ossigeno, movimentazione del brodo, produttività e filtrazione. È influenzata dalle condizioni dell’inoculo, dalla composizione del terreno, dalla storia di taglio, dall’ossigeno disciolto, dal pH, dalla limitazione dei nutrienti e dal funzionamento della girante.
Per questo motivo, la morfologia dovrebbe essere monitorata nell’ambito dello sviluppo del processo, invece di essere considerata soltanto un’osservazione microscopica. L’analisi delle immagini, le misurazioni delle dimensioni dei pellet, la reologia, la concentrazione di biomassa e i dati sul trasferimento di ossigeno possono aiutare a collegare la morfologia alle prestazioni del processo.
Considerazioni sul bioreattore a monte
Utilizzare sistemi di agitazione ad alta coppia
Le apparecchiature di agitazione devono essere selezionate in base alla viscosità massima prevista del brodo e alla tensione di snervamento, non solo in base al terreno iniziale. Motore, albero, guarnizioni e riduttore devono sopportare una coppia elevata durante l’accumulo di biomassa e in condizioni operative transitorie.
Un azionamento a velocità variabile è utile perché il processo può richiedere un taglio da basso a moderato durante la crescita iniziale e un maggiore apporto di potenza nelle fasi successive per mantenere la circolazione e il trasferimento di ossigeno. Il sistema di controllo dovrebbe inoltre rilevare le condizioni di sovraccarico prima che si verifichino danni meccanici o una perdita significativa di miscelazione.
Selezionare le giranti in base alla reologia effettiva
Le giranti idrofoil sono spesso utili nelle colture viscose e sensibili al taglio perché forniscono una forte circolazione assiale con un uso relativamente efficiente della potenza. Nei recipienti alti possono essere necessarie più giranti per ridurre i gradienti verticali di concentrazione e ossigeno.
Le turbine Rushton possono garantire un’efficace dispersione del gas, ma il loro elevato taglio locale e il flusso prevalentemente radiale possono renderle meno adatte come unica scelta di girante nelle colture altamente viscose o sensibili alla morfologia. La selezione dovrebbe basarsi sui dati relativi a dispersione del gas, circolazione, taglio, assorbimento di potenza e aumento di scala, non soltanto sul nome della girante.
Progettare il recipiente per favorire la circolazione
I deflettori, la distanza tra le giranti, il rapporto d’aspetto, la posizione dello sparger e la distanza dal fondo del recipiente influenzano tutti la presenza di zone stagnanti. Una configurazione che garantisce un tempo di miscelazione accettabile con acqua può non funzionare quando il brodo diventa pseudoplastico o contiene aggregati filamentosi.
Le unità pilota dovrebbero quindi essere testate con una reologia rappresentativa o con brodo di coltura reale. Il tempo di miscelazione, il consumo di potenza, la risposta dell’ossigeno disciolto e l’accumulo locale di solidi dovrebbero essere misurati nell’intero intervallo operativo previsto.
Fornire un’aerazione e un controllo dell’ossigeno robusti
L’aerazione dovrebbe essere progettata per mantenere l’ossigeno disciolto al di sopra del minimo specifico dell’organismo e del processo per tutta la durata della coltura. Una strategia di controllo pratica può utilizzare in cascata agitazione, flusso d’aria, arricchimento con ossigeno, contropressione o un’altra variabile autorizzata all’aumentare della richiesta di ossigeno.
Il solo flusso di gas può essere insufficiente in un brodo viscoso, poiché le bolle possono coalescere, bypassare il liquido o distribuirsi in modo non uniforme. La combinazione di sparger e girante deve favorire la frammentazione e la dispersione del gas senza creare una schiuma eccessiva o danneggiare la morfologia desiderata.
Controllare la schiuma e la gestione dei gas di scarico
Le colture filamentose possono produrre molta schiuma a causa di proteine, polimeri extracellulari, detriti cellulari e componenti del terreno sensibili agli antischiuma. Durante la progettazione delle operazioni unitarie dovrebbero essere considerati sonde per la schiuma, rompischiuma meccanici, aggiunta controllata di antischiuma e filtri di scarico adeguatamente dimensionati.
L’antischiuma può ridurre il trasferimento di ossigeno e interferire con filtrazione, estrazione, cromatografia o operazioni a membrana. Il suo impiego dovrebbe pertanto essere valutato come un compromesso di processo, anziché essere trattato come una correzione di routine.
Mantenere uniformità di pH e temperatura
La generazione di calore e la richiesta di ossigeno possono aumentare con la concentrazione di biomassa. Una circolazione insufficiente può causare differenze locali di temperatura e pH anche quando la sonda di controllo segnala un valore stabile nel liquido sfuso.
Il recipiente dovrebbe avere un’adeguata capacità di trasferimento del calore, sonde posizionate correttamente e una miscelazione sufficiente a distribuire rapidamente le aggiunte di acido, base e alimentazione. In caso contrario, l’aggiunta localizzata dei reagenti può causare stress chimico o osmotico temporaneo.
Differenze di processo in base all’applicazione
Produzione di antibiotici
La sintesi degli antibiotici è comunemente influenzata dalla fase di crescita, dalla morfologia, dalla limitazione dei nutrienti, dall’ossigeno disciolto, dal pH e dalla disponibilità di precursori. Il processo può richiedere una transizione controllata dalla formazione della biomassa alla produzione di metaboliti secondari.
Il bioreattore dovrebbe quindi supportare un’alimentazione riproducibile, il controllo dell’ossigeno, variazioni di temperatura ove applicabili e il campionamento sia della biomassa sia della concentrazione del prodotto. Un’elevata concentrazione di biomassa non è automaticamente vantaggiosa se produce una viscosità eccessiva o riduce il trasferimento di ossigeno.
Idrolisi enzimatica dell’amido
Nei processi amilolitici, l’alimentazione può contenere amido sospeso o solidi parzialmente idrolizzati. L’operazione unitaria deve mantenere questi solidi in sospensione evitando al contempo un’eccessiva sedimentazione, concentrazioni locali di substrato o danni alla coltura indotti dalla miscelazione.
La viscosità può cambiare sostanzialmente durante l’idrolisi dell’amido. Agitazione, pompaggio, trasferimento di calore e filtrazione a valle dovrebbero essere valutati sia rispetto allo stato iniziale ad alto contenuto di solidi sia rispetto allo stato dell’idrolizzato a viscosità inferiore.
Idrolisi enzimatica della cellulosa
I processi cellulolitici possono coinvolgere materiali fibrosi o lignocellulosici con distribuzioni granulometriche ampie. Questi alimenti creano ulteriori difficoltà nella sospensione dei solidi, nell’abrasione, nell’intasamento, nel campionamento e nel trasferimento di calore.
Le apparecchiature dovrebbero includere una strategia adeguata per la gestione dei solidi, come una preparazione appropriata dell’alimentazione, una disposizione di sparger e giranti che limiti le zone morte e linee di trasferimento progettate per tollerare le fibre. La produzione dell’enzima e l’idrolisi possono inoltre essere effettuate in fasi separate, a seconda dell’organismo e dell’obiettivo del processo.
Requisiti di monitoraggio e controllo
Misurare più dell’ossigeno disciolto
Una singola sonda per l’ossigeno disciolto può non rilevare i gradienti presenti in un brodo viscoso e filamentoso. Tra le misurazioni utili figurano velocità di agitazione, carico o coppia del motore, flusso d’aria, arricchimento con ossigeno, ossigeno e anidride carbonica nei gas di scarico, pH, temperatura, pressione, schiuma e portate di alimentazione.
Quando possibile, le misurazioni del trasferimento e del consumo di ossigeno dovrebbero essere correlate alla morfologia della biomassa e alla formazione del prodotto. Ciò aiuta a distinguere una vera limitazione biologica da un problema di miscelazione o di misurazione.
Monitorare reologia e morfologia
La viscosità dovrebbe essere misurata in condizioni pertinenti al processo, poiché la viscosità apparente dipende dalla velocità di taglio. Semplici misurazioni a basso taglio potrebbero non prevedere le prestazioni di pompe, giranti o filtri.
Il monitoraggio della morfologia può identificare la crescita indesiderata dei pellet, un’eccessiva frammentazione o una crescita miceliale dispersa prima che tali condizioni causino un grave malfunzionamento del processo. L’obiettivo non è imporre una morfologia universale, ma identificare quella che supporta il prodotto previsto e le operazioni unitarie coinvolte.
Pianificare un aumento di scala rappresentativo
La scalabilità basata esclusivamente sulla velocità periferica della girante o sul volume del recipiente è generalmente insufficiente. I processi con Actinomiceti richiedono una decisione deliberata su quale criterio debba avere la priorità, come capacità di trasferimento dell’ossigeno, potenza per unità di volume, tempo di miscelazione, esposizione al taglio o morfologia.
Criteri diversi di aumento di scala possono produrre condizioni operative differenti. I dati pilota dovrebbero quindi essere raccolti in un intervallo di impostazioni di agitazione e aerazione, anziché in un singolo punto nominale.
Operazioni unitarie a valle
Separare la biomassa in base alla posizione del prodotto
Per gli enzimi extracellulari, il prodotto può rimanere nel liquido chiarificato, rendendo la rimozione della biomassa e la separazione dei solidi operazioni centrali. Filtrazione rotativa, centrifugazione, filtrazione a strati o chiarificazione a membrana possono essere appropriate a seconda della lunghezza dei filamenti, della struttura dei pellet, del carico di solidi e della sensibilità del prodotto.
Per i prodotti intracellulari o associati alle cellule, la sequenza di separazione cambia perché l’obiettivo diventa il recupero della biomassa. La posizione del prodotto dovrebbe determinare la prima operazione a valle.
Recuperare e purificare gli antibiotici con attenzione
Il recupero degli antibiotici può comprendere la rimozione della massa cellulare, l’estrazione liquido-liquido, l’adsorbimento o la cromatografia, la concentrazione, la filtrazione di finitura, la cristallizzazione o la formazione di sali e l’essiccazione. La sequenza esatta dipende dalla solubilità, dalla stabilità, dalla carica e dal comportamento di ripartizione del composto.
Gli estrattori centrifughi possono supportare l’estrazione liquido-liquido continua, mentre evaporazione, filtrazione ceramica o in linea, centrifugazione e liofilizzazione possono essere utilizzate nelle fasi successive. Queste operazioni richiedono il controllo della compatibilità con i solventi, della temperatura, del pH, della separazione delle fasi e della degradazione del prodotto.
Progettare considerando fouling e carico di solidi
La biomassa filamentosa può intasare rapidamente filtri, membrane, superfici di trasferimento del calore e linee di trasferimento strette. Le apparecchiature a valle dovrebbero essere dimensionate utilizzando dati realistici sul carico di solidi e sulla capacità dei filtri, ottenuti da brodo rappresentativo.
Anche i punti di campionamento e trasferimento richiedono attenzione. Linee progettate male possono trattenere biomassa, creare difficoltà di pulizia o bloccarsi quando il brodo si raffredda o la sua reologia cambia.
Integrare la sicurezza di solventi ed essiccazione
L’estrazione degli antibiotici può introdurre solventi infiammabili o tossici, richiedendo contenimento adeguato, ventilazione, compatibilità dei materiali e sistemi di recupero dei solventi. Evaporazione e liofilizzazione devono essere selezionate considerando la stabilità termica e all’umidità del prodotto.
I sistemi pilota dovrebbero dimostrare non solo il recupero del prodotto, ma anche il riciclo dei solventi, la pulizia, la gestione dei rifiuti e il funzionamento sicuro in condizioni di deviazione plausibili.
Comprendere i compromessi
Una maggiore agitazione non risolve ogni problema
Aumentare l’agitazione può migliorare la circolazione nel liquido sfuso e il trasferimento di ossigeno, ma aumenta anche il fabbisogno di potenza, il taglio locale, la generazione di calore e il rischio di modificare la morfologia. Un taglio eccessivo può frammentare le ife o alterare la struttura dei pellet in modi che riducono la produttività o peggiorano la separazione a valle.
L’obiettivo corretto è il più basso apporto pratico di potenza che mantenga le prestazioni richieste di ossigenazione e miscelazione.
Un maggiore flusso d’aria può aumentare la formazione di schiuma e i problemi di gestione dei gas
Un flusso d’aria più elevato può aumentare il trasferimento di ossigeno, ma può anche incrementare la schiuma, la ritenzione di gas, il carico sui filtri di scarico e le perdite di solventi o componenti volatili. L’arricchimento con ossigeno o la contropressione possono fornire una capacità di trasferimento aggiuntiva, ma introducono ulteriori requisiti operativi e di sicurezza.
La strategia dell’ossigeno dovrebbe essere valutata insieme ad agitazione, progettazione dello sparger, controllo della schiuma e capacità di scarico.
Le giranti Rushton e idrofoil non sono intercambiabili
Una turbina Rushton può essere utile quando la dispersione del gas rappresenta il principale limite, mentre una girante idrofoil può essere preferibile quando la circolazione assiale e l’efficienza energetica sono più importanti. Nessuna delle due geometrie è universalmente corretta per tutti i brodi di Actinomiceti.
La scelta della girante deve essere convalidata in base alla viscosità, alla morfologia, al contenuto di solidi, alla richiesta di ossigeno e alla sensibilità al taglio della coltura.
L’antischiuma può creare penalizzazioni a valle
L’antischiuma riduce le interruzioni legate alla schiuma, ma può diminuire le prestazioni di trasferimento dell’ossigeno e rendere più difficili la chiarificazione o la lavorazione a membrana. Lo sviluppo iniziale del processo dovrebbe determinare la dose minima efficace e valutare, ove praticabile, opzioni non chimiche per il controllo della schiuma.
Una buona lettura nel liquido sfuso può nascondere un problema locale
Letture stabili di pH, temperatura e ossigeno disciolto non dimostrano che l’intero recipiente sia omogeneo. Pellet densi, crescita sulle pareti, solidi sedimentati o zone di alimentazione scarsamente miscelate possono comunque subire gravi limitazioni locali.
Gli studi di miscelazione, il campionamento in più punti e le osservazioni della morfologia sono importanti misure di salvaguardia durante la convalida pilota.
Applicare la progettazione all’obiettivo del processo
Le operazioni unitarie richieste dovrebbero essere scelte come una catena integrata, dall’inoculo e dalla fermentazione fino alla separazione, alla purificazione e alla gestione del prodotto finale.
- Se il focus principale è la produzione di antibiotici: dare priorità a morfologia riproducibile, capacità di trasferimento dell’ossigeno, alimentazione controllata, monitoraggio dei metaboliti secondari, recupero selettivo, compatibilità con i solventi, purificazione e controlli della stabilità del prodotto.
- Se il focus principale è l’idrolisi dell’amido: dare priorità alla sospensione di elevati carichi di solidi, alla resistenza ai cambiamenti di viscosità, alla produttività dell’amilasi, al controllo di calore e pH e ad apparecchiature di chiarificazione dimensionate per il carico di solidi previsto.
- Se il focus principale è l’idrolisi della cellulosa o di materiali lignocellulosici: dare priorità alla preparazione dell’alimentazione, alla miscelazione e al trasferimento compatibili con le fibre, alla gestione dei solidi, alla resistenza all’abrasione, al controllo del fouling e a una decisione chiara sull’esecuzione della produzione enzimatica e dell’idrolisi in un’unica fase o in fasi separate.
- Se il focus principale è la formazione presso un impianto pilota: includere il monitoraggio della coppia, sistemi di controllo in cascata dell’ossigeno, misurazioni di morfologia e reologia, dimostrazioni di filtrazione o estrazione, salvaguardie per solventi e rifiuti e convalida della pulizia.
Un processo di successo con Actinomiceti mantiene le condizioni biologiche che producono il risultato desiderato, fornendo al contempo a ogni operazione unitaria a valle un brodo che può gestire in modo affidabile.
Tabella riassuntiva:
| Area del processo | Considerazioni principali | Obiettivo principale |
|---|---|---|
| Agitazione e miscelazione | Azionamento ad alta coppia, giranti adatte, circolazione nel recipiente e test reologici rappresentativi | Mantenere il brodo omogeneo ed evitare zone stagnanti |
| Aerazione e trasferimento dell’ossigeno | Progettazione dello sparger, cascata agitazione-flusso d’aria, arricchimento con ossigeno, contropressione e capacità di scarico | Soddisfare la richiesta di ossigeno durante la crescita filamentosa |
| Morfologia e reologia | Monitoraggio di ife, pellet, aggregati, viscosità, coppia e consumo di ossigeno | Controllare produttività, esposizione al taglio e gestione a valle |
| Schiuma, pH e temperatura | Sonde per la schiuma, rompischiuma meccanici, antischiuma controllato, trasferimento di calore adeguato e sonde posizionate correttamente | Prevenire l’instabilità del processo e lo stress localizzato |
| Produzione di antibiotici | Alimentazione controllata, monitoraggio dei metaboliti secondari, estrazione, purificazione e controlli della stabilità del prodotto | Massimizzare il recupero proteggendo la qualità del prodotto |
| Idrolisi dell’amido | Sospensione di elevati carichi di solidi, variazione della viscosità, produttività dell’amilasi e capacità di chiarificazione | Gestire i solidi in modo affidabile durante l’idrolisi |
| Idrolisi della cellulosa | Preparazione dell’alimentazione, trasferimento compatibile con le fibre, resistenza all’abrasione, controllo del fouling e selezione delle fasi | Trattare materiali fibrosi senza intasamenti o usura eccessiva |
| Processamento a valle | Separazione della biomassa, filtrazione, membrane, estrazione, essiccazione, recupero dei solventi e convalida della pulizia | Garantire un recupero del prodotto affidabile e sicuro |
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